Spacing
Расстояние между элементами изображения по каждой оси.
Цифровая анатомия
Один срез не показывает всю форму
На отдельном изображении ветвящаяся структура может выглядеть как небольшой круг. Чтобы увидеть её продолжение, нужны соседние срезы, пространственные параметры и понятный путь построения модели.
Схемы объясняют геометрию метода и не содержат данных пациента.
Один срез
Круг на изображении может быть частью длинной ветви
Представьте трубку, которая через несколько миллиметров разделяется. Плоскость до развилки пересекает только общий ствол. На одном срезе мы увидим округлую область и ничего не узнаем о продолжении структуры.
Объём появляется из последовательности таких участков. Поэтому ошибка на нескольких соседних срезах может разорвать ветвь или соединить два объекта, хотя каждый отдельный кадр выглядит правдоподобно.
Три представления одного объекта
- Маска — элементы объёмного изображения, отнесённые к структуре.
- Поверхность — внешняя граница выделенного объёма.
- Осевая линия — условный путь вдоль ветвящейся структуры.
Они связаны, но не взаимозаменяемы: линия не хранит всю толщину, а одна поверхность не показывает, насколько однозначно граница видна на исходных изображениях.
Координаты
Размер модели хранится не в количестве точек
У изображения есть шаг между элементами, начало координат и направления осей. Если эти сведения потерять при экспорте, модель может сохранить знакомую форму, но получить неверный масштаб или ориентацию.
Origin
Физические координаты элемента изображения с индексом (0, 0, 0).
Direction
Направления осей изображения относительно пространства.
Эти параметры описаны в документации SimpleITK. При передаче модели важно сохранять их вместе с единицами измерения.
Два изображения
Наложение показывает результат, но не доказывает точность
Совмещение ищет преобразование между системами координат. Совпадение одной заметной точки может выглядеть убедительно, пока удалённая область остаётся смещённой.
До расчёта выбирают интересующую область, допустимый тип преобразования и способ независимой проверки. Если объект деформировался, одного поворота и перемещения недостаточно — это уже другая модель задачи.
Разобрать проверку совмещения →Передача модели
Что должно остаться рядом с файлом
- ссылка на исходные изображения;
- пространственные параметры и единицы;
- правила выделения структуры;
- ручные изменения и спорные области;
- назначение, для которого модель подготовлена.
Без этой связи объёмная картинка быстро превращается в файл неизвестного происхождения.
Посмотреть историю модели