Ориентиры настройки
Используются для расчёта преобразования и сохраняются вместе с его версией.
Проверка совмещения
Преобразование можно настроить так, что выбранный ориентир останется на месте, а удалённая область сместится. Проверка должна происходить там, где результат действительно нужен специалисту.
Допустимое расхождение и способ контроля определяются для конкретной исследовательской задачи.

Простой геометрический пример
Положите два прозрачных рисунка друг на друга и закрепите их кнопкой в одной точке. Теперь поверните верхний лист. Кнопка останется на месте, а удалённые участки разойдутся.
Такое локальное совпадение может выглядеть убедительно на экране. Оно ничего не говорит о точности в области, которая действительно интересует специалиста.
Настройка и контроль
Ошибку на точках настройки можно учитывать, но её недостаточно для независимой оценки. Нужны контрольные точки или области, не участвовавшие в подгонке.
Используются для расчёта преобразования и сохраняются вместе с его версией.
Не участвуют в подгонке и показывают, что происходит там, где нужен результат.
Остаются в отчёте вместе с объяснением возможной причины.
Модель преобразования
Жёсткое преобразование сохраняет форму объекта: меняются положение и ориентация. Если между исследованиями форма изменилась, более сложная модель может описать это лучше, но требует собственных ограничений и проверки.
Общий состав задачи — преобразование, мера сходства и настройки расчёта — описан в SimpleITK Registration Overview.
Отчёт о совмещении